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100 道真实实验题,最强模型只拿 66.7%:OpenAI 把「湿实验判读」做成了一场考试

2026年11月9日1 次阅读
100 道真实实验题,最强模型只拿 66.7%:OpenAI 把「湿实验判读」做成了一场考试

导语

11 月 6 日,OpenAI 发布了一个叫 BioBasicsBench 的评测基准:100 道题,全部来自真实实验室的原始数据——凝胶图、菌落平板、显微 Z 栈、测序读段、酶标仪导出、甚至实验台上拍的照片。它不问模型「什么是 PCR」,只问:这块胶上哪几个菌落是对的?这个对照板能不能用?这批数据够不够下结论?

最高档推理设置下,GPT-6 Astra 拿到 66.7%。这个分数听起来不低,但发布稿里最值得看的是失败案例:在一道菌落 PCR 题上,Astra 把条带分对了组,然后按「PCR 产物更大 = 克隆成功」的直觉选了 4、6、7、8 号菌落——标准答案是 5、9、10。选错意味着它会让实验员去纯化一支还带着原始质粒的菌。

(本文基于多家媒体转述整理,数字与细节以 OpenAI 11 月 6 日官方发布、R&D World 的逐题复盘、Unite.AI 的技术梳理为准。)

先把三件最容易误读的事说在前面:这不是一个新的生物模型,被测的是通用大模型;只测了 OpenAI 自己的 7 个模型,没有 Claude、Gemini 或任何开源模型;66.7% 不等于「AI 能做实验」,OpenAI 自己在发布里写了「更高的基准分数还不等于模型能在实验室里做出可靠判断」。

3分钟看懂

  • 是什么:BioBasicsBench,一个 100 题的湿实验判读基准。合作方是酶设计公司 Ligo Biosciences。
  • 题目从哪来:Ligo 的科学家把自己真实做过的实验(包括做失败的、图拍糊的)改写成题目,每题配一份详细评分标准。
  • 题目长什么样:输入可以是凝胶与免疫印迹图、菌落平板照片、显微图像栈、测序读段、酶标仪导出表、实验台照片、操作视频,还会附带梯标图、质粒图谱这类参考材料。有的题要把好几种证据串起来看。
  • 怎么打分:模型要给出结构化结论、测量值或操作建议;评分标准按「数字对不对」「推理站不站得住」「有没有主动说证据不足」分别给分。最后算的是平均得分率。
  • 题目质量怎么保证:每题三道审——另一位没参与出题的 Ligo 科学家、一位外部 PhD 级湿实验科学家、最后一轮内部终审(连题面、证据、评分标准、出题人备注和一次模型作答一起看)。
  • 测了多少:7 个 OpenAI 模型 × 多个推理档位 = 37 组「模型 + 设置」组合,每题跑 5 次,一共 18,500 条评分结果。
  • 最好成绩:最高档 xhigh 下,GPT-6 Astra 66.7%(95% 置信区间 60.3–73.1),GPT-6.1 Sol 62.0%,GPT-5.6 Sol 43.8%,GPT-5.5 35.4%,GPT-5.2 31.2%。
  • 效率也变了:Astra 每题平均输出 4,704 个 token,GPT-5.6 Sol 是 9,099 个。也就是分数高的那个,token 花得只有一半。
  • 最该记住的一句:它测的不是「模型懂不懂生物学」,而是「模型能不能把眼前的证据一路带到正确结论」——而这条路,现在还在半途。

为什么「看图答题」比想象中难

在这之前,生物领域的 AI 评测大多建在论文里的图上。论文图是被挑过的:对照组漂亮、条带清晰、该出现的现象都出现了。可真实实验室里最常遇到的是另一套东西——跑歪的胶、长满杂菌的板、对焦没对准的显微图、两组数据互相矛盾。

BioBasicsBench 想卡的就是这一段。它的题目不要求模型背知识,而是要求四件事同时做到:读数准(把条带位置、菌落数、荧光强度读对)、看穿实验设计错误(对照加错了、标签写错了、检测通道重叠了)、把证据串起来(图 A 和图 B 是不是同一件事)、以及在证据不足时闭嘴。

最后那条最反直觉。通用助手被训练成「尽量给答案」,而实验判读的正确动作经常是「这批数据不能支持任何结论,重做」。评分标准里专门为「明确说出证据不足」留了分。

这也是为什么 66.7% 这个数不好直接类比成考试成绩:分母里有一部分题,是「什么都不做、直接说做不了」才拿分的。

失败案例比成功案例更有信息量

OpenAI 在发布里主动放了几道做错的题,这部分是整篇里最值得读的。

错误一:把「产物更大」当成「克隆成功」

菌落 PCR 那道题。Astra 先把各个泳道的条带正确分成了两组——观察层面没错。然后它套了一个常见直觉:PCR 产物更大,说明目的片段插进去了。于是它选了 4、6、7、8 号;参考解读是 5、9、10 号,那几道的条带才和「新产物」那一列对上。按它的建议往下走,下一步就是去养错菌、纯化错质粒。

这个错误类型很典型:观察对了,判断错了。它不是看不懂胶,而是把一条不成立的因果链当成了默认规则。

错误二:菌落数多了 12%

一道计数题上,Astra 没能把挨在一起的菌落分开、漏掉了明显的菌落、又把空琼脂标成了菌落,最终比参考值多算了约 12%。在平板计数里这不是小误差——上样体积和稀释倍数固定时,计数偏高 12% 会让「DNA 导入效率」这个指标同步虚高 12%,直接污染后续所有比较。

错误三:把一张「知识」当成了「观察」

有一道题里,Astra 给出了「液泡通常比周围细胞质更暗」的普遍结论,但那张图里恰好有更亮的液泡。它自己的中间步骤甚至写了「对比度会随焦平面变化」——它看见了,但没让这个观察进入最终结论。

做对的那道,恰好相反

另一道克隆题里,GPT-5.6 Sol 看到阴性对照板上一个菌落都没长,就认定对照成立。Astra 注意到板子边缘手写的「LB Kan50」——那批实验用的是氨苄青霉素,不是卡那霉素。这块板加了错误的抗生素,本来就不该长菌,所以它作为阴性对照无效。Astra 拒绝了这块板,然后重新读主实验的泳道。

OpenAI 把这类进步归因于原生多模态能力变强:能读手写标签、能分辨检测通道、能认出显微图是一组不同深度的 Z 栈而不是「细胞消失了」。

分数表要怎么看

把人话版本摊开:

  • GPT-6 Astra(xhigh):66.7%,置信区间 60.3–73.1,每题约 4,704 token
  • GPT-6.1 Sol:62.0%
  • GPT-5.6 Sol(xhigh):43.8%,置信区间 37.6–50.0,每题约 9,099 token
  • GPT-5.5:35.4%
  • GPT-5.2:31.2%

两点要注意。第一,置信区间宽。100 道题的样本量摆在那,60.3 到 73.1 这个区间意味着「Astra 比 Sol 强」这件事成立,但「Astra 大概在 67 分」这个精度不成立。第二,跨代差的跳跃集中在多模态那一段:GPT-5 系列到 GPT-6 系列涨了 20 个百分点上下,而同一代内部不同档位之间的差距要小得多。这跟「模型更会看原始图像」的解释是一致的。

OpenAI 原话:「更高的基准分数还不等于模型能在实验室里做出可靠判断。」这句不是客套——上面那三道错题就是它自己的注脚。

怎么用:把它当成选型工具,不是能力证明

  1. 如果你在给实验室挑模型:先看你要它做哪一类活。这批题覆盖蛋白方法、成像与流式、定量与测定、核酸方法与分子克隆五大块。你的日常如果 80% 是分子克隆,那就重点看克隆相关题的表现,而不是总分。
  2. 如果你在做 Agent 产品:注意它的失败模式——「观察对、结论错」。这类错误靠加提示词约束「结论必须引用具体观察项」能压下去一部分,靠换更强的模型也能压一部分,但两者不能互相替代。
  3. 如果你要搭自己的评测:这套题的结构可以直接照搬——真实原始数据 + 详细评分标准 + 三审 + 每题多次采样。最贵的不是模型调用费,是让 PhD 级实验科学家写评分标准的时间。
  4. 如果你只想判断「能不能让它替我读板」:现在不行。菌落计数多 12%、选错菌落这两类错误,落到真实项目里就是一周的培养和白做。
  5. 正确的使用姿势:人机配合。让模型做第一遍读数与异常提示,让实验员做最终判定。R&D World 引的 Benchling AI 负责人那句话说得直白:「LLM 配上合适的工具链和人在环里,是能在湿实验里干活的。」

适用场景

  • 模型选型:同一个实验室在 GPT-5 与 GPT-6 之间做预算决策时,这类任务级评测比通用榜单有用得多。
  • Agent 产品的能力边界声明:要给客户写「本产品能做什么、不能做什么」,这里的失败案例可以直接引用。
  • 自建评测的模板:出题流程、评分维度、三审机制都可以照抄,换成自己实验室的数据。
  • 实验记录的二次核查:把历史凝胶图、平板照片丢给模型做异常提示(对照缺失、条带异常),人再复核。
  • 新人培训的反例库:那些「看着像对其实错」的判读,本身就是很好的教学素材。

不适用场景

  • 当成「AI 会做实验」的证据:题目是判读,不是动手;不涉及移液、时序、无菌操作。
  • 当成跨厂商横评:只测了 OpenAI 自家 7 个模型,没有任何第三方模型参评,不能推出「Astra 强于 Claude/Gemini」。
  • 当成生物模型进展:这里没有新的蛋白模型、没有新权重、没有新结构预测能力。它是评测,不是模型。
  • 当成可直接下载的数据集:目前公开渠道没看到完整题目与评测脚本的独立托管地址(GitHub 检索为 0 结果),发布稿说的是公开任务描述、评测方法与基线结果。
  • 外推到临床或法规场景:100 道题、单一数据来源,离监管可接受的验证强度差得远。

避坑

  • 别写「OpenAI 发布生物模型」。BioBasicsBench 是评测基准,被测的是通用模型。
  • 别把 66.7% 写成「准确率」或「成功率」。它是「平均得分率」,评分标准里包含推理质量与不确定性表达,不是对错二值。
  • 别忽略样本量。100 题、每题 5 次,置信区间上下浮动六七个点,排名靠前的几档差距可能被区间吃掉。
  • 别把 66.7% 和 43.8% 的对比当成「一代更比一代强 23 个点」的通用结论。这是同一家公司在同一个基准上的代际差,换个任务集不一定复现。
  • 注意 token 数的读法。Astra 每题 4,704 token、Sol 9,099 token,说明分数提升不是靠「想更久」。反过来,如果只比分数不比成本,会误判部署代价。
  • 别把「题目来自真实实验」写成「数据已经公开」。两者不是一回事。

成本 / 时间

  • 看结论的时间:官方发布一篇 + R&D World 的逐题复盘一篇,两篇读完约 15 分钟,够判断要不要跟进。
  • 复现成本:目前拿不到完整题目与评分脚本,所以「自己在本地跑一遍」这件事暂时做不到,只能引用公开分数。
  • 自建同类评测的成本结构:真正的开销是「把真实实验改写成题 + 写评分标准 + 三审」。按 100 题、每题三审算,是几百个专家小时的量级;模型调用费反而是零头(18,500 条结果,按当前价格算是几十到几百美元)。
  • 部署建议:如果只想用它做选型参考,读分数就够;如果要把这套方法搬进自己的实验室,先做 10 题的迷你版验证流程,再扩到 100 题。

行动建议

  1. 先看失败案例那一节,再回来看分数。理解「观察对、结论错」这个模式,比记住 66.7% 有用。
  2. 核对你关心的任务类型。分子克隆、成像、蛋白方法三块的难度不一样,总分掩盖了这一点。
  3. 如果你在实验室推 AI 工具:把「AI 读数 + 人工复核」当成默认流程写进 SOP,别让任何一步自动放行。
  4. 如果你在做评测:抄它的三审机制,但把题目换成你自己实验室的历史数据——那才是真正能预测「在你这里好不好用」的测试集。
  5. 盯后续:OpenAI 说这些结果会进入它的生物安全评估。如果它后面放出完整题目集或引入第三方模型横评,这个基准的价值会明显上升;如果一直只有自家模型的分数,它更像一份产品材料。

参考来源

(本文基于多家媒体转述整理。)

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